Управления госавтодорнадзора являются правопреемниками реорганизованной в 2005 году Российской транспортной инспекции (далее - РТИ). Указанный контрольно-надзорный орган был создан при Министерстве транспорта РФ более пятнадцати лет назад, в 1991 году с территориальными представительствами (инспекциями практически во всех субъектах РФ). Начальником Управления реорганизованного подразделения стал Лямов Николай Сергеевич на период с 01.01.2005 по 09.11.2006, на данный момент Николай Сергеевич занимает пост заместителя Мэра Москвы в Правительстве Москвы по вопросам транспорта и развития дорожно-транспортной инфраструктуры. Его приемником в период с 10.11.2006 по 29.02.2012 Пономарев Геннадий Иванович. В период с 15.05.2012 г и по настоящее время Начальником Управления является Высоцкий Игорь Юрьевич. Первостепенной задачей инспекции было обеспечения строгого соблюдения законодательства и нормативно-правовых актов в сфере транспорта, и таким образом создание цивилизованного рынка транспортных услуг. Это было своевременное и правильное решение так как «старые» предприятия разваливались, а вновь создаваемые предпочитали действовать под «пиратским флагом», не уделяя должного внимания безопасности своих клиентов. Для реализации поставленных целей Правительство РФ наделило Южного УГАДН полномочиями по выдаче разрешительных документов (лицензий) практически на все виды перевозочной деятельности, а так же на обслуживание и ремонт подвижного состава, осуществление дорожных работ. С точки зрения критериев, установленных Федеральным Законом «О лицензировании отдельных видов деятельности» это было правильное решение, так как транспортные средства, являются источниками повышенной опасности и при условии не надлежащего их использования, обслуживания и ремонта могут причинить вред жизни, здоровью и имуществу граждан. В компетенцию контрольно-надзорной деятельности Южного УГАДН входили в той или иной степени все виды транспорта, практически все виды перевозок, в том числе и международные, а так же необходимые для осуществления ими нормальной деятельности организации и коммуникации. Это позволяло отслеживать ситуацию на транспорте в комплексе. С созданием института полномочных представителей Президента по федеральным округам появилась необходимость в обеспечении его достоверной информацией в целом за округ по всем направлениям деятельности, в том числе и на транспорте. Это привело к тому, что отделения Южного УГАДН находившиеся в центрах федеральных округов получили полномочия по координации деятельности аналогичных отделений входящих в соответствующие округа. Южное УГАДН координирует деятельность Управлений госавтодорнадзора, находящихся на территории субъектов РФ в пределах Южного федерального округа.